フォルダオプションには、隠しファイルの表示の有無を切り替えるオプションがあります。
しかし、この設定を変更してもそれが反映されず、元に戻ってしまう場合は、下記の操作を試してみましょう。


レジストリ エディタを起動します。
# レジストリ エディタの画面左側のツリーで下記のキーを捜します。

HKEY_LOCAL_MACHINE
SOFTWARE
Microsoft
Windows
CurrentVersion
Explorer
Advanced
Folder
Hidden
SHOWALL

# 右側に CheckedValue という名前の DWORD値がありデータが 0 になっていたら、 1 に変更します。

なお、この CheckedValue の値を改変するウィルスも存在します。設定を自分で変更した心当たりがなければ、念のためウィルスに感染していないかどうかもチェックしておきましょう。